益生菌一般是定殖在人体肠道里面的，也不是说数量越多就越好，尤其是小孩子的肠道空间相对于成人要小很多，如果摄入太多菌量反而会影响肠胃运作，所以要选择合适的量。
益生菌的过度危害：
(1)人体长期使用益生菌产品，肠道功能逐渐丧失繁殖益生菌的能力。 随着时间的推移，人体肠道产生依赖性在医学上被称为益生菌依赖性。 当人们患上益生菌依赖症时，他们会依靠合成的口服益生菌产品来维持他们健康的一生。
(2)人体内细菌必须按一定比例平衡。 失衡也会对益生菌造成危害。 除了依赖性，严重的细菌也会引起新的感染。 例如肝硬化患者、门静脉高压导致胃肠道粘膜充血、粘膜屏障功能下降，可通过胃肠道许多病原菌受损的粘膜进入血液，引起致命的菌血症、败血症或腹膜炎。
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