益生菌能够调理胃肠的正常菌群，有帮助消化的作用。对于治疗幽门螺旋杆菌感染有着辅助治疗的作用，并没有直接杀菌的作用。如果有幽门螺旋杆菌感染，最好是通过用四联疗法进行治疗控制疾病的发展。一般建议选择保护胃黏膜的药物奥美拉唑配合果胶铋，然后再选择两种抗生素，用阿莫西林或者克拉霉素也可以用甲硝唑这一类的药物进行治疗，才能够取得良好的治疗效果。
治疗幽门螺旋杆菌感染，需要用足剂量，足疗程的方法才能够达到彻底的根治。在用药物治疗期间，如果表现出有消化不良的症状的时候，可以适量的服用益生菌来辅助治疗。
在菌群中，益生菌对人体的好处最大，能使肠道正常蠕动，让粪便轻松排出体外，加入肠道中缺乏了益生菌，便便可能就不顺畅了。除此以外，益生菌还有不少机能，包括：修复肠道受损黏膜，形成保护罩——菌膜屏障，促进钙、镁等多种营养物质的消化吸收，合成B族，维生素k等维生素，减少脂肪聚集，清理肠道废物，帮助管理体重，维持人类好身材，促进肠道及其免疫系统的发育成熟，避免因接触过敏原导致的人体过敏反应。除了作用于肠道，益生菌还对人体的其他器官有好处。
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